В соответствии с указанным постановлением разрешения выдаются при осуществлении промышленного рыболовства, прибрежного рыболовства, рыболовства в научно-исследовательских и контрольных целях, рыболовства в учебных и культурно-просветительских целях, рыболовства в целях аквакультуры (рыбоводства), организации любительского рыболовства, в иных случаях, предусмотренных Федеральным законом «О рыболовстве и сохранении водных биологических ресурсов».
Выдача разрешений производится территориальными органами Федерального агентства по рыболовству на основании заявлений о выдаче разрешений на добычу (вылов) водных биологических ресурсов, представленных российскими не находящимися под контролем иностранного инвестора юридическими лицами или находящимися под контролем иностранного инвестора юридическими лицами в случае, если контроль иностранного инвестора в отношении таких юридических лиц установлен в порядке, предусмотренном Федеральным законом «О порядке осуществления иностранных инвестиций в хозяйственные общества, имеющие стратегическое значение для обеспечения обороны страны и безопасности государства», индивидуальными предпринимателями и гражданами, а также иностранными пользователями с учетом требований, правил и ограничений рыболовства, установленных законодательством Российской Федерации.
Разрешения, а также являющиеся неотъемлемой частью разрешений документы, позволяющие достоверно установить внесение изменений в разрешение, приостановление, аннулирование разрешения, должны находиться на каждом судне, а также у лица, осуществляющего добычу (вылов) водных биологических ресурсов без использования судов.
Разрешения выдаются в отношении каждого судна, осуществляющего рыболовство в форме электронного документа, подписанного усиленной квалифицированной электронной подписью уполномоченного должностного лица территориального управления, в том числе с использованием федеральной государственной информационной системы «Единый портал государственных и муниципальных услуг (функций)». Разрешение может быть выдано в форме документа на бумажном носителе по желанию лица, обратившегося с заявлением о выдаче разрешения, в случае, если указанным лицом осуществляется ведение рыболовного журнала в форме документа на бумажном носителе.
Бланк разрешения в форме документа на бумажном носителе является документом строгой отчетности, имеет учетные серию и номер.